La maggior parte dei pesci d'acquario proviene da acque tropicali e ha bisogno di temperature d'acqua comprese tra i 22 e i 30 °C. Negli acquari di comunità con pesci e invertebrati di diverse regioni si è dimostrata ideale una temperatura di 24-26 °C. Soltanto per l'allevamento di ciclidi disco raccomandiamo 30 °C. Molte specie di gamberi vengono da acque più fredde e non sopportano temperature di 25-30 °C. 

Si imposta la temperatura dell'acqua con un termoriscaldatore che la regola automaticamente. A questo scopo sono disponibili termoriscaldatori a forma di bacchetta con diverse potenze elettriche che si installano nell'acquario (JBL ProTemp s). Inoltre sono disponibili riscaldatori esterni/istantanei con due potenze elettriche (JBL ProTemp e) da integrare nel tubo flessibile che riporta l'acqua dal filtro esterno. Il vantaggio dei riscaldatori esterni è che si ha un prodotto in meno da sistemare nell'acquario. Anche la distribuzione del calore è più uniforme. Inoltre il display digitale del riscaldatore esterno indica sempre la temperatura dell'acqua in modo leggibile. Naturalmente è anche possibile far funzionare i riscaldatori esterni con una pompa d'acqua separata. 

Il riscaldamento del fondo NON è fatto per regolare la temperatura dell'acqua. Il cavetto riscaldante serve per avere un flusso continuo dell'acqua nel terriccio dell'acquario, dato che l'acqua riscaldata dal cavetto sale e quella fresca scende. I nutrienti raggiungono meglio le radici delle piante e ne favoriscono una loro crescita perfetta. I cavetti riscaldanti vanno sempre affiancati da un "riscaldatore centrale" (JBL ProTemp s oppure e).